根據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引，高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定條件可以分為門檻性指標(biāo)和評價性指標(biāo)，其中門檻性指標(biāo)屬于必要條件，即有任一條件不滿足便不能認(rèn)定為高新技術(shù)企業(yè)。門檻性指標(biāo)包括以下七項：

1、一票否決權(quán)：不具備知識產(chǎn)權(quán)的企業(yè)不能認(rèn)定為高新技術(shù)企業(yè)。

2、兩級分層制：擴(kuò)大了知識產(chǎn)權(quán)的范圍，將國防專利、國家新藥、國家一級中藥保護(hù)品種等納入進(jìn)來，更為合理、利好于涉農(nóng)、涉醫(yī)藥等特殊行業(yè)的企業(yè)。而兩級分類的模式，也充分考慮了不同知識產(chǎn)權(quán)的價值、創(chuàng)造性要求、授權(quán)審批嚴(yán)格程度等方面，這有利于相關(guān)行業(yè)的企業(yè)充分利用其知識產(chǎn)權(quán)、合理維持其高新資質(zhì)。兩級區(qū)分的意義在于I類知識產(chǎn)權(quán)在有效期限內(nèi)可以無限制使用，而II類知識產(chǎn)權(quán)則只能使用一次。

3、排他性權(quán)屬要求：要求須在中國境內(nèi)授權(quán)或?qū)徟鷮彾?，并在中國法律的有效保護(hù)期內(nèi)，且知識產(chǎn)權(quán)權(quán)屬人應(yīng)為申請企業(yè)。同時，在申請高新技術(shù)企業(yè)期間及高新技術(shù)企業(yè)資格存續(xù)期內(nèi)，知識產(chǎn)權(quán)有多個權(quán)屬人時，只能由一個權(quán)屬人在申請時使用。這表明，不少集團(tuán)企業(yè)內(nèi)的關(guān)聯(lián)公司已經(jīng)不能通過共享的方式分別申請高新資質(zhì)。

4、知識產(chǎn)權(quán)相關(guān)技術(shù)對其主要產(chǎn)品（服務(wù)）在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用。所謂主要產(chǎn)品（服務(wù)）是指高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）中，擁有在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán)，且其收入之和在企業(yè)同期高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入中超過50%的產(chǎn)品（服務(wù)）。

5、有效性要求

申請認(rèn)定時，專利的有效性以企業(yè)申請認(rèn)定前獲得授權(quán)證書或授權(quán)通知書并能提供繳費收據(jù)為準(zhǔn)。該要求明確了專利等有效性的認(rèn)定標(biāo)準(zhǔn)——書面證明資料。雖然授權(quán)通知書專利有效性的證明力較授權(quán)證書弱，但是繳費收據(jù)提供了強(qiáng)有力的輔助。

6、弱化時效性要求 

考慮到知識產(chǎn)權(quán)獲取的難易程度等因素，《工作指引》弱化了時效性的要求。具體來說，按Ⅱ類評價的知識產(chǎn)權(quán)在申請高新技術(shù)企業(yè)時，僅限使用一次，而對于I類知識產(chǎn)權(quán)則沒有次數(shù)限制。較于舊《管理辦法》和《工作指引》的“近三年內(nèi)取得”而言，其時效性限制弱化。從時效性限制改為次數(shù)限制,Ⅱ類知識產(chǎn)權(quán)依然可以使用三年（因為一次高新認(rèn)定的有效期為三年），而I類知識產(chǎn)權(quán)則以其本身的有效期作為限制。

2、主要產(chǎn)品（服務(wù)）是指其收入之和在企業(yè)同期高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入中超過50%的產(chǎn)品（服務(wù)）。這是新提出的定量性要求，事實上有利于知識產(chǎn)權(quán)“核心支持作用”的認(rèn)定。

其中，技術(shù)性收入包括：

1、統(tǒng)計方法：全年月平均數(shù)企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)、科技人員數(shù)均按照全年月平均數(shù)計算。

月平均數(shù)＝（月初數(shù)＋月末數(shù)）÷2

全年月平均數(shù)＝全年各月平均數(shù)之和÷12

年度中間開業(yè)或者終止經(jīng)營活動的，以其實際經(jīng)營期作為一個納稅年度確定上述相關(guān)指標(biāo)。

2、職工總數(shù)的統(tǒng)計口徑：企業(yè)職工總數(shù)包括企業(yè)在職，兼職和臨時聘用人員。在職人員可以通過企業(yè)是否簽訂勞動合同或繳納社會保險費（增加了一種鑒別方式，實踐中早有采用，資料準(zhǔn)備時應(yīng)考慮直接提供相應(yīng)證明資料）來鑒別；兼職、臨時聘用人員全年須在企業(yè)累計工作183天以上。當(dāng)然，職工總數(shù)的統(tǒng)計要將科技人員包括在內(nèi)。

3、科技人員的范圍：企業(yè)科技人員是指直接從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動，以及專門從事上述活動管理和提供直接服務(wù)的人員，包括在職、兼職和臨時聘用人員，并且累計工作時間在183天以上。

企業(yè)研究開發(fā)費用占比是企業(yè)近三個會計年度（實際經(jīng)營期不滿三年的按實際經(jīng)營時間計算）的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比值。

《管理辦法》要求：

最近一年銷售收入小于5,000萬元（含）的企業(yè)，比例不低于5%；最近一年銷售收入在5,000萬元至2億元（含）的企業(yè)，比例不低于4%；最近一年銷售收入在2億元以上的企業(yè)，比例不低于3%。其中，企業(yè)在中國境內(nèi)發(fā)生的研究開發(fā)費用總額占全部研究開發(fā)費用總額的比例不低于60%；值得注意的是，銷售收入為主營業(yè)務(wù)收入與其他業(yè)務(wù)收入之和。主營業(yè)務(wù)收入與其他業(yè)務(wù)收入按照企業(yè)所得稅納稅申報表的口徑計算。

2、企業(yè)研究開發(fā)活動（研發(fā)項目）的確定

研發(fā)活動的確定方法，包括行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)判斷法、專家判斷法和目標(biāo)或結(jié)果判定法。其中，目標(biāo)或結(jié)果判定方法是前兩種方式的輔助方法。企業(yè)應(yīng)按照研究開發(fā)活動的定義填寫<<高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請書>>中“四.企業(yè)研究開發(fā)活動情況表”。

3、研發(fā)費用的歸集方法 

企業(yè)應(yīng)正確歸集研發(fā)費用，由具有資質(zhì)并符合《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)進(jìn)行專項審計或鑒證。企業(yè)的研究開發(fā)費用是以單個研發(fā)活動為基本單位分別進(jìn)行測度并加總計數(shù)。以單個研發(fā)活動為基本單位則省去了運(yùn)用費用分?jǐn)倷C(jī)制的麻煩。企業(yè)應(yīng)對包括直接研究開發(fā)活動和可以計入的間接研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用進(jìn)行歸集，并填寫《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請書》中的“企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表”。企業(yè)應(yīng)按照“企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表”設(shè)置高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專用研究開發(fā)費用輔助核算賬目，提供相關(guān)憑證及明細(xì)表，并按要求進(jìn)行核算。

4、研發(fā)費用的歸集范圍 

包括人員人工費用；直接投入費用；折舊費用及長期待攤費用；無形資產(chǎn)攤銷費用；設(shè)計費用；裝備調(diào)試費用與試驗費用；委托外部研究開發(fā)費用和其他費用，并且其他費用由不得超過研究開發(fā)總費用的10％調(diào)整為20%，包括技術(shù)圖書資料費、資料翻譯費、專家咨詢費、高新科技研發(fā)保險費，研發(fā)成果的檢索、論證、評審、鑒定、驗收費用，知識產(chǎn)權(quán)的申請費、注冊費、代理費，會議費、差旅費、通訊費等其他費用所占比例有所提高。